A finales de los años ochenta del siglo XX, un grupo de profesores de diversos departamentos de la Facultad de Medicina y de la de Psicología, cuyo campo de investigación era la Neurociencia, solicitaron y obtuvieron de la Universidad de Granada un Programa de Doctorado en Neurociencias, germen de lo que sería el actual Instituto de Neurociencias.
Previamente, en 1955, se creó en la Facultad de Medicina de Granada el Instituto “Federico Olóriz Aguilera” de Estudios Anatómicos, vinculado a la cátedra de Anatomía de la misma Facultad, para recuerdo de tan insigne anatómico (O. M. de 30 de diciembre de 1955). Este instituto fue promovido por los profesores Miguel Guirao Gea, catedrático de Anatomía de Granada y Miguel Guirao Pérez, catedrático de Anatomía de Valladolid. A un periodo de importante actividad de dicho instituto (ver apartado de documentos), le siguió otro de decadencia que lo llevó prácticamente a la extinción.
A principios de la década de 1990, el director del Instituto de Estudios Anatómicos, el Profesor Miguel Guirao Pérez, para evitar la desaparición del Instituto, ofreció la posibilidad de que los profesores del Programa de Doctorado en Neurociencias formaran parte del mencionado Instituto. Por acuerdo mutuo, los profesores del programa de Doctorado en Neurociencias se incorporaron y se renombró el Instituto, que pasó a denominarse oficialmente como Instituto Universitario de Investigación de Neurociencias “Federico Olóriz”. Desde ese momento, dejó de ser un Instituto de Estudios Anatómicos y pasó a ser un Instituto de Investigación en Neurociencias. La continuidad en el tiempo de ambas etapas del Instituto, hace que el Instituto de Investigación de Neurociencias Federico Olóriz sea el decano de los Institutos de investigación de la Universidad de Granada y el segundo en antigüedad entre los Institutos de España.
El nuevo Instituto de Neurociencias heredó del antiguo una sala y dos despachos que tenía adjudicado en el departamento de Anatomía de la Facultad de Medicina. En ese momento, la Facultad de Medicina estaba localizada en la avenida de Madrid nº 11, en el edificio que hoy ocupa el Edificio V Centenario. En este espacio cedido por el departamento de Anatomía, se localizó la secretaría, la dirección y la sala de reuniones. La investigación se hacía en los laboratorios que cada miembro del Instituto de Neurociencias tenía en sus respectivos departamentos y facultades. Esta situación continuó así hasta que, en 2007, el Instituto de Neurociencias de la Universidad de Granada se trasladó al Centro de Investigación Biomédica, recién construido en el Parque Tecnológico de la Salud de Granada. En este centro se le adjudicó al Instituto de Neurociencias diversos laboratorios y espacios de reunión, secretaría y dirección. Por primera vez en su historia, el Instituto de Neurociencias disponía de laboratorios propios donde sus investigadores podían trabajar y colaborar de manera más estrecha. Culminando así un anhelado deseo de los miembros del Instituto de Neurociencias.
Con objeto de compartir los resultados de la investigación del Instituto de Neurociencias a la comunidad científica y a la sociedad en general, desde 2006 el Instituto organiza bianualmente unas jornadas científicas denominadas: Jornadas del Instituto de Neurociencias, en colaboración con el Parque de las Ciencias de Granada. Estas jornadas tienen lugar en el contexto de la Semana Mundial del Cerebro, que se celebra habitualmente en el mes de marzo.
Los cargos directivos del Instituto de Neurociencias han sido:
Directores/as: José María Peinado Herreros, Miguel Guirao Piñeyro, José Manuel Baeyens Cabrera, Francisco Vives Montero, Milagros Gallo Torre, Blanca Gutiérrez Martínez y el actual José Manuel Rodríguez Ferrer.
Subdirectores/as: Milagros Gallo Torre, Blanca Gutiérrez Martínez, José Manuel Rodríguez Ferrer, Raquel Durán Ogalla y la actual Margarita Rivera Sánchez.
Secretarios/as: Miguel Guirao Piñeyro, Francisco Javier Cañizares García, José Manuel Baeyens Cabrera, Francisco Vives Montero, Milagros Gallo Torre, Eduardo Fernández Segura, Francisco Jesús Arrébola Vargas y el actual Fernando Gámiz Ruiz.